Pongo aquí lo que he deducido de los cables del conector de la moto para el Kit de Peugeot.
CoP-1 - BE - Bleu - Azul - Apertura del cofre (va al bloque 44 del esquema)
CoP-2 - VE - Vert - Verde - es la tierra del circuito. (CORREGIDO, había visto mal el esquema)
CoP-3 - JN - Jaune - Amarillo - NO TENGO NI IDEA, DEBE SER LA ANTENA! (en el esquema sale suelto)
CoP-4 - GR/RG - Gris/Rouge - Gris/Rojo - Toma de +12V (la misma linea va al mechero, bloque 69)
CoP-5 - Vacío (ayuda a la comprobación de la numeracion)
CoP-6 - GR/NR - Gris/Noir - Gris/Negro (este me lo sabía por el chocolate :P ) - luces de freno (bloque 14)

En el esquema de la Alarma JSE668 la antena va aparte saliendo de su propia terminal, así que el supuesto amarillo del CoP, no lo necesitamos si es que mi suposicion de que es la antena es cierta.
El resto de cables que salen de la JSE668 son (a partir de ahora los nombraré como las letras):
JSE-a - Red - Batery(+) - Que supongo que vaya directamente al positibo de la batería
JSE-b - Black - ACC - Es para el encendido a distancia de la moto (No sé si lo usaremos)
JSE-c - Orange - Direction light - Para unas luces, p.e. intermitentes derechos.
JSE-d - Cambridge Blue - Direction light - Para otras luces, p.e. intermitentes izquierdos.
JSE-e - Yellow/Red - Starting - Es para conectar el arranque de la moto, nosotros conectaremos la apertura de maletero, correspondiente al CoP-1 (No sé si hay que usar este ó el JSE-b)
JSE-f - Black/White - Flameout wire (to lock) (No lo usaremos)
JSE-g - White/Black - Flameout wire (No lo usaremos)
JSE-h - Green - GND - Aquí conectaremos la tierra, correspondiente a CoP-2
JSE-i - Cable extra con arandela, que también es verde, así que supongo que va directamente a tierra para posibles derivaciones de corriente, habrá que atornillarlo al negativo de la bateria (supongo...) o al chasis de la moto (si es que el chasis está conectado al - de la batería, que debería...)

Nota1: Los flameout son para una funcionalidad de la alarma de parar el motor de la moto en caso de que te la roben, o en supuestos casos de emergencia, como nuestro cable JSE-e lo conectamos a la apertura del maletero y no al motor de la moto, no los necesitamos. Conectar el motor sería un pifostio impresionante, además no lo recomiendo, porque nuestras llaves ya van codificadas, y es mejor eso que una codificación inalambrica que se puede saltar más facilmente.
Nota2: aunque el cable a tiene su propio fusible, no lo conectaremos directamente a la batería si no que pasará por la caja de fusibles, es decir, utilizaremos el cable CoP-4, que ya pasa por los fusibles de la moto. Ambos fusibles son de 10 así que supuestamente no habrá ningún problema, en caso de fallo seguramente pete el de la caja de fusibles de la moto, que es el que tiene más dispositivos conectados y por tanto más demanda (lo digo para que sepáis cual habría que cambiar), no obstante no puenteeis ninguno de los dos por seguridad.

Más vale multímetro en mano que ciento volando, me he subido la batería a casa y he estado haciendo pruebas y mediciones de las señales de los cables.
Al activar 2 veces el boton del rayo el cable JSE-e recibe un pulso de 12V (debe tener de ancho más o menos medio segundo), el JSE-b sin embargo se queda con una tension constante a 12V. Para quitar la tensión del JSE-b, se da a desactivar la alarma y volveremos a tener una tensión estabilizada de -0.5V.
Con lo cual he deducido que el JSE-b es el que utilizan en el video para conectarlo a las luces del freno para que se queden encendidas, es decir se conecta al CoP-6. Y el JSE-e es el que va al motor de apertura del cofre, yendo conectado al CoP-1
Por tanto, las conexiones quedan así:

JSE-a ---> CoP-4
JSE-b ---> CoP-6
JSE-c ---> Intermitentes derechos. Cable Azul Cielo (en el esquema electrico: Bleu Ciel = BC)
JSE-d ---> Intermitentes izquierdos. Cable Naranja (en el esquema electrico: Orange = OR)
JSE-e ---> CoP-1
JSE-f ---> Sin conectar
JSE-g ---> Sin conectar
JSE-h ---> CoP-2
JSE-i ---> Todavía no he decidido si conectarlo directamente a la batería o no, debido al JSE-h
Y así quedaría! sólo habría que unirlos con una regleta para empalmar cables de estas de tornillos y listo.
Todavía me quedaría montarlo en la moto, y hacer alguna que otra medición previa para estar seguro. Y por supuesto a ver si alguien localiza el color de los cables de los intermitentes derecho e izquierdo, ya sea en el esquema electrico o en la propia moto. Pero ya me quedo tranquilo habiendo resuelto lo de las conexiones.
Para no tocar los cables de la moto (todavía estoy en garantía), lo que voy a hacer va a ser comprar un conector Mini-Fit Macho Aéreo de 6 vías para que enganche directamente con el de la moto.
En la foto de Osi (gracias Osi60) se ve claramente el color de los cables de intermitentes. Son los azul cielo (bleu ciel = BC) y naranja (orange = OR), para los que tengan el esquema.

Ahora falta localizarlos cerca de donde vamos a instalar la alarma, proximo a la caja de fusibles. A ver que conectores hay para modificar lo menos posible los cables de la satelis.
Ya está todo comprobado, funciona bien la alarma y están todas las conexiones correctas.
Faltaría ver ñamejor opcion de fijar la cajita negra y la sirena al chasis de la moto, yo como siempre, intentaré buscar una solución que no modifique nada de la moto. Ambos traen un adhesivo que para el caso de la sirena nos puede valer, pero en el caso de la centralita de alarma, tiene que estar situada de forma horizontal y hay que mirarlo mejor.
Los intermitentes los voy a dejar sin conectar porque prefiero currarme un circuito de seguridad para que no le lleguen tensiones a la centralita que no debieran llegar, porque no sé si la propia centralita de la moto le podría afectar de alguna forma. Pero eso lo haré en un brico aparte.

Probablemente no lo pueda acabar el montaje hasta mediados de febrero. Pero ya tenéis todas las conexiones y el modo de hacerlo. Podéis ir montandolo ya!
Por seguridad, siempre comprobad todas las conexiones antes de colocarlo en la moto, no vaya a haber algun cable suelto, o algún cortocircuito.
Gracias y un saludo! Hasta la proxima entrega!

Algunas fotos del montaje:

Material que he empleado:
- Conector Hembra aereo de 6 vias y sus pines (se compra en una tienda de electronica por menos de un euro)
- Fundas termorretráctil, para cubrir los cables y el conector, pero podéis pasar de esto o hacerlo con cinta aislante.
- soldador y estaño
- Alicates o tijeras en su defecto, y unas pinzas para no quemarse.
- pequeño cutter.

Foto ampliada de los pines y el conector a emplear, por si lo quereis imprimir y enseñarlo en la tienda, fijaros que algunos de los agujeros no son del todo cuadrados.

Pelar cables (fijarse en la longitud, mejor pasarse y recortar despues), rascar el cobre con el cutter, enrollarlos y dar una capa de estaño (como en el negro), ponemos el pin y soldamos con el estaño.

Fijaos como se coloca el pin, porque despues de soldar la parte trasera del pin se aprieta con los alicates, presionando la cobertura plastica del cable. Además la longitud no debe sobrepasar de los orificios de los laterales. Y tened cuidado al soldar no quede demasiado estaño, pues por encima tiene que quedar un canal para meterlo en el conector.

Colocación de los cables según lo expuesto en las conexiones.

Otra vista.

El cable terminado con el termorretráctil y todo colocado
Como veis en la moto solo hay que enchufar y listo!

Es un poco más laborioso, con los pines y el conector y todo eso, pero así nos ahorramos el tener que estar pelando cables en la moto, si os parece demasiado siempre podéis comprar una regleta de esas de tornillos, y pelar los cables y empalmarlos a pelo.